Троицкая церковь в селе Кесьма была освящена по завершении постройки в честь праздника Рождества Пресвятой Богородицы. Дата постройки последнего здания: 1765-1788 гг.
Село Кесьма принадлежало известному роду дворян Батюшковых. Здесь жил и работал писатель Александр Иванович Куприн. На кладбище Троицкой церкви похоронен старший судовой врач крейсера «Варяг», кавалер ордена Св. Георгия Михаил Николаевич Храбростин.
В 1940-х годах, после затопления Весьегонска Рыбинским водохранилищем, село Кесьма было районным центром.